Characterisation and genetic determinism of robustness indicators in fattening pigs
Caractérisation et déterminisme génétique d’indicateurs de la robustesse chez le porc en croissance
Résumé
In the context of global warming and changing societal expectations, livestock, especially pigs, evolve in an increasingly changing and challenging environment. The ability of an animal to cope with these changes while ensuring the expression of its production potential can be associated with its robustness. However, the evaluation of robustness in farm animals remains a complex subject. The objective of this thesis is to characterize the robustness of fattening pigs through indicators and to estimate their genetic parameters. Two approaches were studied: a first named “static” and a second named “dynamic”. The static approach was based on the use of phenotypes recorded routinely on selection farms in order to define several indicators (R) related to pigs’ robustness. The “dynamic” approach focused on the use of time-series data recorded from automatic feeders. Based on these data and a conceptual energetic allocation model, the trajectory of the energetic allocation coefficient to growth was modeled by a dynamic linear model. Following a two-step modelling approach, the genetic variance and the genetic variance of the residual, trait LSR, of the allocation coefficient were estimated. The genetic determinism of traits R and LSR, associated to robustness, were modeled showing low but non-zero heritabilities. These traits showed favorable correlations with fattening growth and unfavorable with feed efficiency traits. This work makes it possible to consider a selection to improve robustness in growing pigs.
Dans le contexte de réchauffement climatique et d’évolution des attentes sociétales, les animaux d’élevage, notamment les porcs, évoluent dans un environnement de plus en plus changeant et challengeant. La capacité d’un animal à faire face à ces changements tout en assurant l’expression de son potentiel de production peut être associée à sa robustesse. Cependant, l’évaluation de la robustesse chez les animaux d’élevages reste un sujet complexe. L’objectif de cette thèse est de caractériser la robustesse des porcs en engraissement au travers d’indicateurs et d’estimer leurs paramètres génétiques. Deux approches ont été étudiées de manière concomitante : une première dite statique et une seconde dite dynamique. L’approche statique s’est basée sur l’utilisation des phénotypes enregistrés en routine dans les fermes de sélection (observations, traitements médicamenteux…) permettant de définir plusieurs indicateurs (R) associés à la robustesse. L’approche dite dynamique a porté sur l’utilisation des données temporelles issues des automates d’alimentation. Sur la base de ces données et d’un modèle conceptuel d’allocation de l’énergie ingérée, la trajectoire du facteur d’allocation de l’énergie ingérée à la croissance a été modélisé par un modèle linéaire dynamique. Suivant une approche en deux étapes, la variance génétique et la variance génétique résiduelle, critère LSR, du facteur d’allocation ont été estimées. Le déterminisme génétique de ces critères R et LSR, associés à la robustesse, a été modélisée montrant des héritabilités faibles mais non nulles. Ces critères ont montré des corrélations favorables avec la croissance en engraissement et défavorables avec les critères d’efficacité alimentaire. Ces travaux permettent d’envisager la mise en place d’une sélection afin d’améliorer la robustesse chez les porcs en croissance.
| Origine | Version validée par le jury (STAR) |
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