Dans cette thèse, nous discutons des progrès réalisés dans le développement d'un microscope à gaz quantique pour l'étude de la dynamique hors équilibre dans des systèmes quantiques isolés après un quench. La perspective de ce travail est d'étudier la dynamique de relaxation des atomes de strontium dans un réseau optique 2D, décrit par le modèle de Bose-Hubbard.Nous présentons le dispositif expérimental développé pour le refroidissement et le piégeage du strontium par laser. En particulier, nous décrivons la simulation et la mise en œuvre d'un nouveau dispositif de collimation du faisceau atomique. Les différentes étapes du refroidissement laser jusqu'au microkelvin sont présentées. Enfin, nous décrivons les implémentations du piège dipôle optique utilisé pour transporter le nuage atomique entre nos deux chambres à vide et piéger les atomes dans un réseau optique 2D.Nous présentons également en détail le travail effectué pour préparer l'étape d'imagerie de fluorescence de l'expérience. Nous décrivons un nouvel algorithme pour analyser les futures images du microscope et le comparons aux méthodes standards. Avec cet algorithme, nous explorons les limites de résolution et de rapport signal à bruit nécessaires pour reconstruire la distribution des atomes avec des sensibilités au site unique et à l'atome unique. Nous avons également effectué des calculs de lightshifts pour le strontium à 1064nm pour l'état fondamental et excité (3P1) afin d'évaluer les paramètres du piège pendant l'imagerie. Enfin, nous calculons la dynamique d'un atome piégé dans le réseau optique. Nous calculons le nombre de photons diffusés et la durée de vie de l'atome dans le piège et discutons des mécanismes de refroidissement mis en jeu.